Daphnia_magna_Genomic_Signature_Data

数据集概述

本数据集围绕大型溞(Daphnia magna)野生种群展开,针对鱼类捕食、寄生、土地利用三种选择压力,通过空间、时间和实验进化维度的基因组扫描,识别与环境压力相关的候选基因组区域及基因,揭示种群基因组水平的差异化选择模式与局部适应规律。

文件详解

  • 说明文档(.docx格式):共10个,包括针对SNP基因分型和微卫星基因分型的空间、鱼类捕食、寄生、土地利用、实验进化场景的说明文件,如README_for_Orsinietal_SNP_genotyping_space.docx、README_for_Orsinietal_micros_genotyping_experiment.docx等,用于解释各场景下的基因分型数据背景与方法。
  • 基因分型数据文件(.xls、.xlsx格式):共10个,包含SNP和微卫星基因分型的空间、鱼类捕食、寄生、土地利用、实验进化数据,如Orsinietal_SNP_genotyping_fishcore.xlsx、Orsinietal_micros_genotyping_landusecore.xls等,记录不同选择压力下的基因分型结果。
  • 序列文件(.fasn格式):1个,即Orsinietal_sequences_outliers_10kbRegions.fasn,包含异常值区域的10kb基因组序列数据。

数据来源

论文“Genomic signature of natural and anthropogenic stress in wild populations of the waterflea Daphnia magna: validation in space, time and experimental evolution”

适用场景

  • 水生生物适应性进化研究:分析大型溞野生种群对自然与人为压力的基因组响应机制。
  • 环境压力基因组关联分析:探究鱼类捕食、寄生、土地利用压力与候选基因的关联。
  • 实验进化验证:通过实验进化数据验证野生种群基因组选择模式的可重复性。
  • 种群遗传学研究:利用基因分型数据解析大型溞种群的遗传结构与变异规律。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 2.34 MiB
最后更新 2026年1月22日
创建于 2026年1月22日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。