数据集概述
本数据集聚焦脊椎动物Na+,K+-ATP酶对强心类固醇毒素的抗性机制,研究氨基酸插入与替换的上位性效应。通过蛋白质工程和分子对接模拟,分析不同物种(如毛丝鼠、沙鸡)相关突变对酶活性及毒素抗性的影响,包含原始实验数据、模拟结果及分子相互作用参数等5个文件。
文件详解
- README_Supplementary_Data.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含数据集标题、作者信息(负责人Susanne Dobler及合作者Shabnam Mohammadi的机构与联系方式)、数据生成时间(2021-02-23)等元数据
- Docking_simulation.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含Protein(蛋白质物种)、BindingAffinity(结合亲和力)字段,记录不同物种Na+,K+-ATP酶与毒素的分子对接结合强度数据
- Hydrogen_bond_distances.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含species(物种)、residue(残基)、distance(距离)字段,记录不同物种酶蛋白中氢键的残基位置及距离参数
- Raw_Assay_Data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:原始实验测定数据,推测包含Na+,K+-ATP酶活性、强心类固醇毒素抗性相关的实验原始记录
- Total_bond_frequency.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:推测包含不同物种酶蛋白中各类化学键的出现频率统计数据
数据来源
Universität Hamburg(Susanne Dobler团队)
适用场景
- 生物医学研究:分析脊椎动物Na+,K+-ATP酶对强心类固醇毒素的抗性机制,探究氨基酸突变的上位性效应
- 蛋白质工程:指导抗毒素酶蛋白的改造设计,优化酶活性与毒素抗性的平衡
- 分子生物学:通过分子对接模拟数据,研究酶蛋白与毒素分子的相互作用模式
- 进化生物学:对比不同物种相关突变的功能差异,揭示毒素抗性的趋同进化路径