数据集概述
本数据集基于RNA-Seq技术,针对胡萝卜花青素生物合成相关的转录因子基因进行识别研究。通过分析不同颜色愈伤组织及黑胡萝卜品种主根发育过程中的基因表达水平,筛选出与花青素含量显著相关的MYB、bHLH和WD40基因,为胡萝卜花青素合成调控机制研究提供数据支持。
文件详解
- 文件名称:Kodama_et_al_2018_Gene_Count_12Sep18.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:文件包含胡萝卜花青素生物合成相关转录因子基因的表达数据,可能涵盖基因ID、不同组织/样本的表达量、与花青素含量的相关性指标等关键信息,具体字段需结合文件内容进一步确认。
数据来源
论文“Identification of transcription factor genes involved in anthocyanin biosynthesis in carrot (Daucus carota L.) using RNA-Seq”
适用场景
- 植物基因调控研究: 分析胡萝卜花青素生物合成途径中的MYB、bHLH和WD40转录因子基因功能。
- 作物品质改良: 挖掘调控花青素合成的关键基因,为胡萝卜品种的花青素含量优化提供靶点。
- 转录组数据分析: 基于RNA-Seq数据研究植物组织特异性基因表达模式与次生代谢的关联。
- 分子生物学实验验证: 为qRT-PCR等后续实验提供候选基因的表达量参考数据。