数据集概述
本数据集包含空肠弯曲杆菌和结肠弯曲杆菌的基因组数据及菌株列表,聚焦泛宿主菌株的宿主传播特性研究。数据支撑对菌株宿主关联信号、跨宿主传播速率及人类感染来源归因的分析,为食源性病原菌溯源提供基因组层面的基础数据。
文件详解
- 文件名称:Dearlove et al_Genomes+IsolateList.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包包含两类核心数据,一是泛宿主弯曲杆菌菌株(ST-21、ST-45、ST-828克隆复合体)的全基因组测序数据,二是对应菌株的列表信息,涵盖菌株来源、宿主类型等元数据,用于分析宿主关联信号及跨宿主传播事件。
数据来源
论文“Rapid host switching in generalist Campylobacter strains erodes the signal for tracing human infections”
适用场景
- 食源性病原菌溯源研究:分析弯曲杆菌泛宿主菌株的宿主关联信号,评估基因组测序在人类感染来源归因中的应用价值。
- 微生物跨宿主传播机制分析:基于基因组数据研究弯曲杆菌在不同动物宿主间的传播速率及泛宿主适应性机制。
- 公共卫生监测:支撑人类弯曲杆菌感染的来源(鸡肉、牛、猪等)分布统计,为制定防控策略提供数据参考。
- 微生物基因组流行病学研究:探究克隆复合体内菌株的遗传结构与宿主特异性的关联,解析宿主切换对基因组信号的影响。