数据集概述
该数据集包含2022年德国瓦登海集群繁殖海鸟因HPAIV H5N1病毒不同基因型导致大量死亡的系统发育地理分析数据,涵盖病毒基因序列、传播路径及相关分析文件,为禽流感传播机制研究提供支持。
文件详解
- 系统发育树文件(.trees格式,3个文件):如COL_AQU_UK_DE_NL__12__MCC.trees,存储病毒进化树结构数据
- 地理可视化文件(.kml格式,3个文件):如COL_AQU_UK_DE_NL__12__MCC.kml,用于展示病毒传播的地理分布
- 序列数据文件(.newick格式,1个文件):COL_AQU_gannet__109__BLU_tern__191__.newick,存储病毒基因序列的进化关系数据
- 数据来源说明文件(.txt格式,1个文件):COL_data_source_acknowledgment_table.txt,记录病毒序列信息的来源实验室及作者
- 方法说明文件(.pdf格式,1个文件):COL_Methods.pdf,详细描述研究采用的实验方法和分析流程
- 数据概览文件(.csv格式,1个文件):COL_alldata_overview.csv,汇总数据集内所有文件的基本信息,包括文件名、描述、格式及所用软件
适用场景
- 禽流感病毒进化研究:分析HPAIV H5N1病毒的基因型变异及进化路径
- 野生动物疾病传播机制研究:探究集群繁殖海鸟中禽流感病毒的传播模式
- 公共卫生风险评估:为沿海地区禽流感疫情防控策略制定提供数据支持
- 分子流行病学分析:结合地理信息与基因数据,揭示病毒跨区域传播规律