数据集概述
本数据集聚焦北美特拉华湾(Delaware Bay)这一禽流感病毒热点区域,研究2000-2008年期间共循环低致病性禽流感(LPAI)病毒的亚型多样性及重配潜力,验证“多样性-涌现假说”,即高病原体多样性的宿主-病原体系统更易出现疾病涌现。数据包含病毒亚型多样性、流行率及重配率估算相关信息。
文件详解
- README文件
- 文件名称:README_for_barton-jae-data.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含研究背景、数据来源说明,提及数据用于发表论文《Subtype diversity and reassortment potential for co-circulating avian influenza viruses at a diversity hot spot》,并说明目录内容(如/spade目录用于物种丰富度估算)。
- 数据压缩包
- 文件名称:barton-jae-data.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含研究相关的原始数据或分析文件,具体内容需解压后查看,推测包含病毒亚型监测数据、流行率统计数据、辛普森指数(Simpson's Index)计算数据等。
数据来源
论文《Subtype diversity and reassortment potential for co-circulating avian influenza viruses at a diversity hot spot》
适用场景
- 生态流行病学研究: 分析宿主生物多样性与病原体多样性的关系,验证“多样性-涌现假说”在禽流感病毒系统中的适用性。
- 禽流感病毒进化分析: 研究病毒亚型多样性变化趋势及其与重配率的关联,评估病毒进化潜力。
- 疾病涌现风险评估: 基于病原体多样性和重配潜力数据,预测禽流感病毒新亚型或高致病性毒株的涌现风险。
- 监测策略优化: 根据监测覆盖率(约63.0%)数据,改进禽流感病毒监测方案,提升未检测亚型的发现效率。
- 宿主-病原体系统研究: 以北美滨鸟及其携带的LPAI病毒为模型,探究宿主物种(如翻石鹬)在病毒重配中的作用。