数据集概述
本数据集包含抹香鲸低线粒体DNA（mtDNA）多样性驱动因素研究的相关数据，涉及全球分布的175个线粒体基因组和3个核基因组分析结果，用于评估种群瓶颈/扩张、文化搭便车或mtDNA选择等假设，揭示气候变迁对其种群的影响。
文件详解
- 序列与日志文件
- 文件名称：All_Pmac_Unique_hap_seqs_strict_100M.log、skygrid_24Jan2017.log.txt等
- 文件格式：.log、.txt
- 字段映射介绍：包含BEAST软件生成的分析日志，记录seed值、运行时间及状态、后验概率、先验概率、似然值等分析参数
- 树文件
- 文件名称：Pac_pma_mito_20Jan2017.trees、All_Pmac_Unique_hap_seqs_strict_100M.trees等
- 文件格式：.trees
- 字段映射介绍：存储基因组序列构建的系统发育树结构数据，用于展示抹香鲸不同种群的遗传关系
- XML配置文件
- 文件名称：Atl_pma_mito_19Jan2017_skyline.xml、skygrid_24Jan2017.xml等
- 文件格式：.xml
- 字段映射介绍：包含BEAST分析的参数配置，如skygrid模型的精度、种群大小、根高度等元数据，支持重复分析与参数调整
数据来源
论文“Demography or selection on linked cultural traits or genes? Investigating the driver of low mtDNA diversity in the sperm whale using complementary mitochondrial and nuclear genome analyses”
适用场景
- 海洋生物遗传学研究: 分析抹香鲸线粒体与核基因组的遗传多样性及种群结构
- 物种进化机制探讨: 评估种群瓶颈、文化搭便车或自然选择对mtDNA多样性的影响
- 气候变迁与物种响应研究: 结合种群历史动态，揭示更新世气候事件对抹香鲸全球分布的作用
- 生物信息分析方法验证: 测试BEAST软件在多基因组数据整合分析中的应用效果
