数据集概述
该数据集包含等足类生物核基因与线粒体基因的序列比对数据，核心围绕生活史特征对核基因替换率的影响展开，涉及382个核基因、12个线粒体基因及视蛋白1基因编码区的比对结果，以及26个物种的线粒体基因组信息。
文件详解
- 文件名称: concatenation_382NuclearGenes.fas
- 文件格式: FAS
- 内容说明: 26个等足类物种的382个核基因串联比对序列，基因经PRANK比对、Gblocks移除模糊位点处理
- 文件名称: concatenation_12MtGenes.fas
- 文件格式: FAS
- 内容说明: 26个等足类物种的12个线粒体蛋白编码基因（含cytb、cox1等）串联比对序列，处理方式同上
- 文件名称: Opsine1_cds.fas
- 文件格式: FAS
- 内容说明: 26个等足类物种视蛋白1基因编码区比对序列，已移除内含子和无义突变
- 文件名称: Mitogenomes_annotated.tar.gz
- 文件格式: GZ
- 内容说明: 26个等足类物种的注释线粒体基因组压缩包
- 文件名称: Mitochondrial_Genomes_Accession_number.pdf
- 文件格式: PDF
- 内容说明: 线粒体基因组在ENA数据库的登录号文档
适用场景
- 分子进化研究：分析等足类生物核基因与线粒体基因替换率差异及影响因素
- 基因组学研究：探究生活史特征与基因进化速率的关联机制
- 生物信息学分析：验证基因比对工具（PRANK、Gblocks）的处理效果
- 系统发育分析：基于核基因与线粒体基因序列构建等足类物种进化树
