数据集概述
本数据集包含Desulfobacterota_B MAG WHTF01_sp021323355的功能注释和标准化基因表达值(geTMM)。该基因组来自Kerbel长期耕作实验根际宏基因组,转录活性高,占总转录活性比例可达百分之三十四。数据涵盖2021年7月常规耕作(CT)和条带耕作(ST)处理下的样本,注释由DRAM v1.4.4生成,表达值基于宏转录组读数映射至非冗余基因目录计算。
文件详解
- 文件名称:Desulfobacterota_B_WHTF01_sp021323355_annotations_geTMM.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含Desulfobacterota_B MAG的功能注释信息(由DRAM v1.4.4生成),以及基于宏转录组读数计算的标准化基因表达值(geTMM),覆盖2021年7月常规耕作(CT)和条带耕作(ST)处理下的样本数据。
适用场景
- 农业微生物组研究:分析长期耕作处理对根际高活性微生物Desulfobacterota_B的功能和表达影响。
- 微生物功能注释验证:基于DRAM生成的注释结果,研究特定微生物基因组的功能特征。
- 基因表达数据分析:利用geTMM值探究耕作方式对微生物转录活性的调控机制。
- 土壤微生物生态研究:结合转录活性占比数据,评估Desulfobacterota_B在根际微生物群落中的生态功能。