数据集概述
本数据集是秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了DG1856品系(携带goa-1(sa734)I基因突变)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验于2009年7月开展,通过tierpsy软件追踪线虫在NGM培养基上的运动,采集了运动特征、轨迹等数据,包含3个核心文件。
文件详解
- 文件1:
goa-1 (sa734)I on food L_2009_07_07__14_19__2_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储线虫行为的特征数据,可能包含运动轨迹、速度、身体弯曲度等量化特征(具体字段基于tierpsy软件输出标准)
- 文件2:
goa-1 (sa734)I on food L_2009_07_07__14_19__2.wcon.zip
- 文件格式:ZIP(含wcon格式文件)
- 字段映射介绍:压缩包内为wcon格式的线虫运动轨迹数据,可能包含时间序列的位置坐标、身体姿态等原始追踪信息
- 文件3:
goa-1 (sa734)I on food L_2009_07_07__14_19__2.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验的基础数据,可能包含视频帧对应的原始追踪结果、骨架分割数据(如6662个分段骨架)等
数据来源
William R Schafer实验室(MRC Laboratory of Molecular Biology, UK);C.elegans behavioural database
适用场景
- 线虫神经遗传学研究: 分析goa-1基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 行为表型量化分析: 利用特征数据研究线虫在食物环境中的运动模式、速度等表型差异
- 神经行为学实验复现: 基于实验参数和追踪数据,复现或验证线虫行为学实验结果
- 行为分析软件验证: 作为tierpsy软件输出数据的实例,用于行为追踪算法的测试与优化