数据集概述
本数据集围绕绿藻属Dictyochloropsis s.l.的分子系统发育与共生选择性展开，包含15株培养菌株及地衣共生藻的18S rRNA、rbcL、ITS序列数据，以及马德拉和台湾两地Lobariaceae科地衣真菌的藻类共享分析结果，揭示该属的多系性及共生选择特征。
文件详解
- 系统发育树文件（.tre格式，共4个）
- 文件名称：RAxML_bipartitions.rbcL.reduced_raxout.tre、RAxML_bipartitions.18S.reduced_raxout.tre、RAxML_result.18S.reduced_raxout.tre、RAxML_result.rbcL.reduced_raxout.tre
- 内容说明：基于18S rRNA和rbcL基因序列构建的系统发育树结果，反映Dictyochloropsis属的进化关系
- 序列比对文件（.fasta格式，共2个）
- 文件名称：18S_alignment.fasta、rbcL_alignment.fasta
- 内容说明：18S rRNA和rbcL基因的序列比对数据，用于系统发育分析
- 综合数据文件（.xlsx格式，共1个）
- 文件名称：DalGrande_et_al_New_Phytol.xlsx
- 内容说明：包含分子系统发育与共生选择性研究的综合数据，可能涉及菌株信息、序列分析结果及地理种群数据
数据来源
论文“Molecular phylogeny and symbiotic selectivity of the green algal genus Dictyochloropsis sensu lato (Trebouxiophyceae): a polyphyletic and widespread group forming photobiont-mediated guilds in the lichen family Lobariaceae”
适用场景
- 绿藻系统发育研究: 利用序列比对和系统发育树数据，分析Dictyochloropsis属的分类地位与进化关系
- 地衣共生机制分析: 探究Lobariaceae科地衣真菌对Dictyochloropsis clade 2藻类的宿主选择性及地理变异
- 生物多样性研究: 基于隐存多样性分析结果，评估Dictyochloropsis属的物种多样性水平
- 共生生态研究: 分析不同地理种群（马德拉、台湾）中地衣真菌与藻类的共享模式及群落水平协同进化特征
