数据集概述
本数据集为论文“Differential DNA methylation in the benign and cancerous prostate tissue of African American and European American men”的汇总统计数据,包含非裔与欧裔男性前列腺良恶性组织的DNA甲基化差异分析结果,涉及不同 ancestry组内组织类型比较及同组织类型内 ancestry比较的多模型分析数据,共7个文件。
文件详解
- 分析结果文件(ZIP格式)
- 文件名称:AA_TumorvBenign_Dummy.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:非裔男性前列腺肿瘤与良性组织CpG位点甲基化差异关联分析结果,采用个体虚拟变量模型控制样本配对效应
- 文件名称:AA_TumorvBenign_MixedModel.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:非裔男性前列腺肿瘤与良性组织CpG位点甲基化差异关联分析结果,采用线性混合模型(患者为随机效应)控制样本配对效应
- 文件名称:EA_TumorvBenign_Dummy.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:欧裔男性前列腺肿瘤与良性组织CpG位点甲基化差异关联分析结果,采用个体虚拟变量模型控制样本配对效应
- 文件名称:EA_TumorvBenign_MixedModel.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:欧裔男性前列腺肿瘤与良性组织CpG位点甲基化差异关联分析结果,采用线性混合模型(患者为随机效应)控制样本配对效应
- 文件名称:Benign_AncestryCompare_Summary.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:良性前列腺组织中非裔与欧裔男性CpG位点甲基化差异关联分析结果(非裔为基线)
- 文件名称:Tumor_AncestryCompare_Summary.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:肿瘤前列腺组织中非裔与欧裔男性CpG位点甲基化差异关联分析结果(非裔为基线)
- 说明文档(TXT格式)
- 文件名称:Summary_Statistics_ReadMe.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:数据集整体说明文档,包含各分析文件的背景、模型方法及结果解释等信息
数据来源
论文“Differential DNA methylation in the benign and cancerous prostate tissue of African American and European American men”
适用场景
- 前列腺癌表观遗传学研究: 分析非裔与欧裔男性前列腺良恶性组织的DNA甲基化差异位点,探究前列腺癌发生的表观遗传机制
- 前列腺癌种族差异机制分析: 比较不同 ancestry组前列腺组织的甲基化特征,揭示前列腺癌种族 disparities的潜在分子基础
- 肿瘤 biomarker 筛选: 基于甲基化差异位点,筛选前列腺癌诊断或预后相关的表观遗传标志物
- 医学统计模型验证: 对比虚拟变量模型与线性混合模型在配对样本甲基化分析中的应用效果与结果差异