数据集概述
本数据集围绕地下水端足类Niphargus属的hrabei和valachicus两种物种展开，包含其基因序列比对、系统发育树及扩散历史可视化文件，用于研究地下生活方式的可逆性及近期向地表水的大规模扩散现象。
文件详解
该数据集包含多种类型的研究文件，具体说明如下：
- 基因序列比对文件（.fas格式）：
- 如N_hrabei_COI_alignment.fas、N_valachicus_COI_alignment(2).fas等：包含COI、ITS等基因标记的序列比对数据
- 系统发育树文件：
- .nwk格式：如Niphargus_BEAST_tree.nwk，为BEAST和RAxML分析得到的系统发育树
- .nex格式：如Niphargus_BEAST_tree.nex，系统发育树的NEXUS格式文件
- 扩散历史可视化文件（.kml格式）：
- 如N_hrabei_dispersal_Gamma_RRW_model.kml、N_valachicus_dispersal_Cauchy_RRW_model.kml等，可通过Google Earth查看物种扩散历史
适用场景
- 进化生物学研究：分析地下生物向地表水扩散的进化机制及生活方式可逆性
- 生物地理学研究：通过KML文件可视化两种Niphargus物种的扩散历史与地理分布
- 分子系统学研究：利用基因序列比对和系统发育树数据，探究物种亲缘关系及演化历程
- 生态学研究：探讨地下水生物适应地表环境的生态策略及环境驱动因素
