DNA_barcode_Source_东非半干旱稀树草原植物DNA条形码库与群落系统发育数据集

数据集概述

本数据集包含肯尼亚Laikipia地区Mpala研究中心采集的东非半干旱稀树草原植物DNA条形码库及群落系统发育数据,涵盖1,781份标本(约460种植物,占已知 flora 的92%)的5种DNA条形码标记(rbcL、matK、trnL-F、trnH–psbA、ITS),可用于物种鉴定、生态进化关系推断等研究,共5个文件。

文件详解

  • bold.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:未提供具体字段信息,推测包含与BOLD数据库相关的植物DNA条形码数据记录
  • final.new
  • 文件格式:NEW
  • 字段映射介绍:未提供具体字段信息,推测为处理后的最终数据文件
  • Alignments.zip
  • 文件格式:ZIP(压缩包)
  • 字段映射介绍:包含DNA序列比对文件,支持系统发育分析
  • BOLD Downloads.zip
  • 文件格式:ZIP(压缩包)
  • 字段映射介绍:包含从BOLD数据库下载的原始DNA条形码数据
  • Gill et al MER Script.Rmd
  • 文件格式:RMD
  • 字段映射介绍:R语言 markdown 脚本,用于数据处理或分析的可复现代码

数据来源

Mpala Research Center(肯尼亚Laikipia地区)

适用场景

  • 植物物种鉴定: 利用DNA条形码标记实现东非稀树草原植物的快速物种识别
  • 群落系统发育研究: 通过系统发育数据推断植物群落的进化关系与结构
  • 生物多样性监测: 支持半干旱生态系统植物多样性的动态评估与保护规划
  • 生态进化关系分析: 探究物种间的生态关联及进化历史对群落构建的影响
  • DNA条形码技术优化: 评估不同条形码标记(单标记或组合)的物种界定能力
  • 生物信息学方法验证: 利用脚本复现数据分析流程,验证系统发育分析方法的可靠性
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 3.02 MiB
最后更新 2026年1月12日
创建于 2026年1月12日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。