数据集概述
本数据集围绕家养与野生动物线粒体基因组分子进化模式展开研究,包含家养哺乳动物、鸟类及其野生近缘种的线粒体基因组序列对比分析数据。通过16组系统发育独立比较,探究驯化对线粒体进化的影响,涉及分支长度、dN/dS比值等关键指标,为分子进化研究提供结构化数据支持。
文件详解
- README文件
- 文件名称:README_for_Data and analysis files for Domestication and the Mitochondrial Genome, Moray et al., GBE.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含数据集背景、作者信息(Camile Moray等)、DOI编号(10.1093/gbe/evu005)及存档数据内容说明,涵盖姐妹对分析数据、全树分析数据、分析结果等模块。
- 压缩数据文件
- 文件名称:Data and analysis files for Domestication and the Mitochondrial Genome, Moray et al., GBE.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含Sister_pairs_data(姐妹对分析数据文件夹)、Whole_tree_data(全树分析数据文件夹)及分析结果文件,具体字段包含基因组序列比对数据、系统发育树数据、dN/dS计算结果等。
数据来源
论文“Domestication and the mitochondrial genome: comparing patterns and rates of molecular evolution in domesticated mammals and birds and their wild relatives”
适用场景
- 分子进化模式研究:分析家养与野生动物线粒体基因组的非同义/同义替换率(dN/dS)差异及分支长度变化。
- 驯化对基因组进化影响分析:验证驯化是否普遍改变线粒体分子进化模式,探究种群规模、选择压力变化的作用。
- 系统发育比较研究:基于16组独立比对数据,开展家养与野生动物类群的系统发育关系及进化速率对比。
- 进化生物学数据支撑:为线粒体基因组进化机制、选择压力变化等领域的研究提供原始数据与分析框架。