动物介导种子传播与植物定植梯度种群遗传结构数据集

数据集概述

该数据集包含动物介导的刺柏种子传播研究相关数据与代码,涉及DNA条形码物种鉴定、SSR遗传标记分析等内容,探究林分成熟度、微生境类型及觅食模式对母系后代分布的影响,为植物-食果动物互作研究提供支持。

文件详解

  • 数据文件:
  • full_dataset.csv:CSV格式,包含种子SSR遗传标记数据,字段如seed_code(种子编码)、FAM01_DFAGA等SSR位点数据
  • coord.csv:CSV格式,包含区域坐标数据,字段有area(区域)、mh(微生境)、ind(个体)、x_coord(X坐标)、y_coord(Y坐标)
  • seed_rain_raw.csv:CSV格式,种子雨原始数据文件
  • seeds_trees.csv:CSV格式,种子与母树匹配数据文件
  • relatedness_matrix.csv:CSV格式,亲缘关系矩阵数据文件
  • seeds_trees_groups_2_mismatch.numbers:Numbers格式,允许2个错配的种子-母树分组数据
  • 代码文件:
  • vif_function.R:R格式,方差膨胀因子计算函数代码
  • Code.Rmd:R Markdown格式,分析代码文件
  • 文档与图片:
  • README.md:Markdown格式,数据集说明文档
  • Figure_1.png:PNG格式,研究相关图表

适用场景

  • 植物种群遗传学研究:分析定植梯度下种群遗传多样性变化
  • 种子传播生态学研究:探究食果动物对种子传播的影响机制
  • 微生境生态研究:评估不同微生境对植物后代分布的作用
  • 森林恢复研究:为次生林自然更新机制分析提供数据支持
  • 遗传标记应用研究:验证SSR标记在母系亲缘关系分析中的有效性
packageimg

数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 23.67 MiB
最后更新 2025年12月11日
创建于 2025年12月11日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。