数据集概述
本数据集围绕豆科植物对根瘤菌的制裁机制展开,研究低成本氮源替代(硝酸盐或高效根瘤菌共接种)对宿主制裁平庸固氮菌株能力的影响,包含实验数据、分析代码及说明文档,为共生互作机制研究提供支持。
文件详解
该数据集包含三十一个文件,具体说明如下:
- 说明文档:
- README.txt、README.md: 文本格式,提供实验背景、数据说明及文件结构等信息。
- 数据分析代码 (.r 格式):
- NoduleNumber_GC_analysis_v2.R、AvgNodWt_strain_GC_analysis.R 等十七个R脚本文件,用于不同实验指标(根瘤数量、平均根瘤重量等)的统计分析。
- 实验数据文件:
- 文本文件 (.txt): 如 batch2podMass_beans2017.txt,包含豆荚重量、种子重量等数据,字段示例有 sample(样本)、wt(g)(重量)。
- CSV文件 (.csv): 如 Growth_chamber_Fall2016_v3.csv(包含样本、菌株、氮处理、根瘤数量等字段)、plantCodes_beans2017.csv(包含批次、植株ID、菌株、重复等字段)。
- R数据文件 (.RData): 如 batch2CombinedData_Edited.RData、batch3_assayPlusSeedYieldEdited.RData 等,为预处理后的R语言数据对象。
- 图片文件 (.png):
- 20170308LB5_plot.png: 实验结果相关图表。
适用场景
- 共生生物学研究: 分析豆科植物与根瘤菌的制裁机制及氮源替代对互作关系的影响。
- 微生物生态学研究: 探究根瘤菌适合度(根瘤大小、PHB积累)与宿主制裁的关联。
- 农业科学应用: 为优化豆科作物固氮效率、减少化学氮肥依赖提供实验依据。
- 生物统计学分析: 作为R语言统计分析(如方差分析、相关性分析)的实践案例数据。