数据集概述
本数据集为西里伯斯飞蜥（Draco lineatus Group）系统基因组学研究数据，包含线粒体序列、SNP、外显子捕获等多类型分子数据，用于探究该物种辐射演化历史、隐存种形成及古杂交事件，支撑15个物种的分类修订及与苏拉威西地质历史的关联分析。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称：README.my.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：数据集说明文档，包含文件用途、分析方法等信息
- 系统发育分析文件
- 文件名称：linGroup_exome_uce.nex
- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：1249个基因座的Nexus格式文件，适用于PAUP或iqTree进行系统发育分析，可直接用于最大似然法快速bootstrap分析
- 文件名称：draco_LinGroup.MTcomplete_613.nex
- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：613个样本的完整线粒体序列Nexus文件，适用于PAUP或MrBayes等软件分析
- 种群遗传分析文件
- 文件名称：lin_hybrids_Imap.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：样本分组映射文件，包含样本编号及对应分组信息（如JAM8604对应A组）
- 文件名称：lineatus_bpp4_exome_97_683.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：外显子捕获数据的BPP分析结果文件，记录物种界定相关统计信息
- 贝叶斯分析控制文件
- 文件名称：LinGroup_exome_683_bpp4.ctl
- 文件格式：CTL
- 字段映射介绍：BPP软件的控制文件，用于物种界定分析的参数设置
- 系统发育模型文件
- 文件名称：linGroup_41samples_612loci_nodel_1x10_9.xml、linGroup_35samples_612loci_noWC_noSNP_1_10-9.xml、linGroup_38samples_612loci_noCC1CC2_1_10-9.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：不同样本子集（41/35/38个样本、612个基因座）的系统发育模型XML文件，用于相关演化分析
适用场景
- 物种分类修订：通过多基因座数据识别隐存种，支撑Draco lineatus Group的物种界定及分类更新
- 生物地理演化研究：结合苏拉威西地质历史，分析物种辐射时间与岛屿形成、合并事件的关联
- 种群遗传结构分析：利用线粒体和SNP数据探究种群分化、基因流及杂交事件
- 系统发育方法验证：比较不同分子标记（线粒体、外显子、SNP）在系统发育重建中的效果
- 地质-生物协同演化分析：探讨苏拉威西岛弧形成对飞蜥物种多样性的驱动作用
