数据集概述
本数据集记录了黑腹果蝇实验种群在四种选择制度下的定量遗传方差测量结果,包括恒定盐富集培养基、恒定镉富集培养基、时间异质和空间异质环境。数据用于分析不同环境制度下种群遗传变异的差异,以及与基因组序列多样性的关联,包含6个相关文件。
文件详解
- 数据文件(共4个,格式均为ZIP)
- 文件名称:Body_mass_salt_diet.zip
- 内容说明:盐饮食环境下果蝇体重相关数据
- 文件名称:Survival_salt_diet.zip
- 内容说明:盐饮食环境下果蝇存活率相关数据
- 文件名称:Survival_cadmium_diet.zip
- 内容说明:镉饮食环境下果蝇存活率相关数据
- 文件名称:Body_mass_cadmium_diet.zip
- 内容说明:镉饮食环境下果蝇体重相关数据
- 代码文件(共2个,格式均为R)
- 文件名称:code2 LikelihoodMCMCglmmVsireTest.R
- 内容说明:用于似然分析的MCMCglmm相关代码
- 文件名称:code1 MCMCglmmAnalysisVsire.R
- 内容说明:用于MCMCglmm分析的主代码文件
数据来源
论文“Quantitative genetic variance in experimental fly populations evolving with or without environmental heterogeneity”
适用场景
- 种群遗传学研究:分析不同环境制度对果蝇种群遗传变异的影响
- 环境异质性与遗传多样性关联分析:探究时空异质环境与恒定环境下遗传方差的差异
- 数量遗传学模型验证:利用MCMCglmm代码复现或扩展实验中的遗传方差分析
- 基因组多样性关联研究:结合已报道的全基因组序列多样性数据,分析数量遗传方差与序列多样性的对应关系