数据集概述
本数据集包含Sussex-LHM和RG品系黑腹果蝇的全基因组重测序相关数据，涵盖比对代码、日志文件及质量控制数据。数据支持下一代测序数据的比对分析，可用于研究果蝇基因组特征及变异情况，总计包含12个文件。
文件详解
- 比对代码文件
- 文件名称：lhm_mapping_scripts.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含下一代测序数据比对所用的代码文件
- 比对日志文件
- 文件名称：lhm_mapping_logs.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含测序数据比对过程中生成的日志文件
- 质量控制数据文件
- 文件名称：dup_counts.zip、readLengthDistr.zip、error_rates.zip、realignment_intervals.zip、qualDistrMetrics.zip、quality_by_cycle.zip、callable_loci.zip等
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含重复计数、读长分布、错误率、重对齐区间、质量分布指标、循环质量、可调用基因座等质控相关数据
数据来源
bioRxiv预印本“Whole genome resequencing of a laboratory-adapted Drosophila melanogaster population sample”（doi: 10.1101/081554）
适用场景
- 基因组学研究：用于分析黑腹果蝇基因组的序列特征、变异位点及进化关系
- 测序数据比对方法验证：评估下一代测序数据比对工具的性能及准确性
- 基因组数据质量控制研究：分析测序数据的质量指标，优化测序实验设计
- 实验室适应种群基因组特征分析：探究实验室适应果蝇种群的基因组变异模式及机制
