数据集概述
本数据集围绕澳大利亚东部黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)的衰老遗传基础展开,包含mth基因单倍型、基因表达及寿命的梯度研究数据,旨在验证mth基因与自然种群衰老及寿命的关联,支持气候适应相关的遗传学分析。
文件详解
- 说明文档类
- 文件名称:README_for_Sgro et al Mol Ecol.docx、README_for_RTPCR raw Cp values.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:分别对应主研究及RT-PCR原始Cp值数据的说明文档,提供数据背景、采集方法及使用指引
- 原始数据类
- 文件名称:RTPCR raw Cp values.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含Technical replication(技术重复)、Population(种群)、Latitude(纬度)、Cp value(Mth_larval/RpL11_larval/Mth_adult_female/RpL11_adult_female/Gapdh2_adult_female)等基因表达相关原始数据字段
- 文件名称:mth_haplotype_2005_raw.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:2005年采集的果蝇mth基因单倍型原始数据
- 文件名称:mean lifespan Dryad 16 APRIL.TXT
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:果蝇平均寿命原始统计数据
- 文件名称:Sgro et al Mol Ecol.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:与主研究相关的补充原始数据
数据来源
论文“Complexity of the genetic basis of aging in nature revealed by a clinal study of lifespan and methuselah, a gene for aging, in Drosophila from eastern Australia”
适用场景
- 衰老遗传学研究: 分析mth基因单倍型、表达量与果蝇寿命的关联,探索自然种群衰老的遗传基础
- 气候适应进化分析: 基于纬度梯度数据,研究果蝇衰老相关性状的气候适应性进化模式
- 基因表达调控研究: 利用RT-PCR原始Cp值数据,分析mth基因在不同发育阶段(幼虫、成年雌蝇)的表达特征
- 分子生态学研究: 验证候选基因(mth)与复杂表型(寿命)在自然种群中的关联程度,评估遗传背景与环境的互作效应