数据集概述
本数据集为东南亚兜兰属(Paphiopedilum)物种多样化研究的支撑数据,包含基于8个叶绿体DNA区域和4个低拷贝核基因的序列比对、系统发育树文件、BEAST分析文件及SplitsTree网络分析文件,用于探究网状进化与海平面波动对该属物种分化的驱动作用,共4个压缩文件。
文件详解
- 文件名称:
Alignment of the sequences upload to Dryad_GYY_20141211.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含用于研究的叶绿体DNA(cpDNA)和低拷贝核基因序列比对数据
- 文件名称:
MP and BI tree files.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含最大简约法(MP)和贝叶斯推断(BI)构建的系统发育树文件
- 文件名称:
BEAST input file and output file.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含BEAST分析的输入参数文件及输出结果文件,用于物种分化时间估算与速率分析
- 文件名称:
SplitsTree_input file.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含用于SplitsTree软件进行网状进化分析的输入文件
数据来源
Dryad数字知识库(关联论文:Reticulate evolution and sea-level fluctuations together drove species diversification of slipper orchids (Paphiopedilum) in Southeast Asia)
适用场景
- 兰科植物进化研究:分析兜兰属物种的系统发育关系与遗传分化模式
- 网状进化机制探究:通过基因树冲突与网络分析,揭示属内杂交或基因渐渗事件
- 物种分化时间估算:利用BEAST输出数据研究地质历史事件(如海平面波动)对物种形成的影响
- 生物地理学分析:结合祖先区域重建结果,探讨兜兰属在东南亚的分布动态与扩散路径
- 植物多样性驱动因素研究:验证海平面波动等环境因子与物种多样化速率的相关性