数据集概述
本数据集聚焦鼓虾属(Alpheus、Synalpheus)幼虫发育、卵大小与基因组大小的关联进化研究,包含37种鼓虾的基因组大小、卵大小、繁殖模式等数据,以及系统发育树文件,支持进化路径分析与性状关联验证,共9个文件。
文件详解
- 数据文件(CSV格式,共5个)
Syn_data_GS_egg_18Oct19.csv:Synalpheus属物种数据,含species(物种)、avg.GS(平均基因组大小)、mean.E(平均卵大小)、Gen.dev(繁殖模式)等字段
synalpheus_repro_PGLS_19-Aug-21.csv:Synalpheus属繁殖性状PGLS分析数据,含egg.size(卵大小)、body.size(体型大小)等字段
alpheus_repro_PGLS_19-Aug-21.csv:Alpheus属繁殖性状PGLS分析数据,字段同Synalpheus属对应文件
Alpheus_data_12Apr21.csv:Alpheus属物种基础数据,包含37种物种的基因组与繁殖相关信息
Syn_data_GS_egg_10-10-19_20191018.csv:Synalpheus属物种基因组与卵大小补充数据,字段同Syn_data_GS_egg_18Oct19.csv
- 系统发育树文件(TRE格式,共3个)
alpheus_bayes.tre:Alpheus属贝叶斯系统发育树
129_syn_larvae_ultra.tre:Synalpheus属幼虫发育超树
129_Gamb_9-15.nex.con.tre:鼓虾属系统发育树文件
- 文档文件(DOCX格式,1个)
Dryad_README_file.docx:数据集说明文档,含数据采集与处理方法
数据来源
Dryad数据平台(对应研究论文:Correlated evolution of larval development, egg size, and genome size across two genera of snapping shrimp)
适用场景
- 进化生物学研究:分析鼓虾属基因组大小与繁殖性状的关联进化模式
- 繁殖生态学分析:探究卵大小、幼虫发育模式对基因组大小的影响机制
- 系统发育比较分析:利用系统发育树文件开展性状关联的系统发育信号验证
- 甲壳动物进化模型构建:基于鼓虾属数据建立繁殖性状与基因组大小的进化路径模型