数据集概述
本数据集包含回声定位蝙蝠(Rhinolophus affinis)耳蜗的microRNA(miRNA)和基因表达数据,涉及2个亚种8个个体。数据涵盖365个miRNA(含121个新miRNA)及匹配mRNA-seq数据,识别出1766个差异表达基因,其中555个受差异表达miRNA负调控,揭示miRNA在蝙蝠回声定位叫声频率变异中的作用。
文件详解
- 文档文件
- 文件名称:README_file.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含数据集标题及各补充文件说明,如实验RNA提取产量、完整性信息,不同蝙蝠物种成熟miRNA序列,样本测序信息等。
- 数据文件(共11个,格式均为XLSX)
- 文件名称:Dryad_file_T1.xlsx
- 字段映射介绍:实验RNA提取产量和RNA完整性数值(RIN)的详细信息。
- 文件名称:Dryad_file_T2.xlsx
- 字段映射介绍:三种蝙蝠物种(Myotis myotis、Myotis lucifugus、Myotis ricketti)的成熟miRNA序列数据。
- 文件名称:Dryad_file_T3.xlsx
- 字段映射介绍:每个样本的miRNA和mRNA测序信息。
- 文件名称:Dryad_file_T4.xlsx、Dryad_file_T6.xlsx、Dryad_file_T7.xlsx、Dryad_file_T8.xlsx、Dryad_file_T10.xlsx
- 字段映射介绍:包含差异表达基因、miRNA调控关系等未完全列举的详细数据内容。
数据来源
Dryad平台(标题为Tables of microRNA and gene expression of an echolocating bat的数据集)
适用场景
- 蝙蝠听觉进化研究:分析miRNA在回声定位蝙蝠叫声频率变异中的调控作用。
- 分子生物学机制研究:探究miRNA对听觉相关基因(如Piezo1、Piezo2、CDH23)的负调控机制。
- 比较基因组学分析:对比不同回声定位哺乳动物的miRNA特征,研究表型进化的分子基础。
- 生物信息学数据分析:结合miRNA和mRNA测序数据,开展差异表达分析与调控网络构建。