数据集概述
本数据集包含美国加州南部沿海仙人掌鹪鹩(Campylorhynchus brunneicapillus)的种群遗传研究数据,涉及22个微卫星位点的363个个体样本。数据涵盖遗传聚类、隔离-by-距离(IBD)分析、栖息地模型等结果,用于探究城市化导致的栖息地破碎化对该物种遗传连通性的影响,共包含6个文件。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称:README_for_IBD_FinalDatasets_Dryad.txt、README_for_cacws_genalex_clusters.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:数据集说明文档,分别对应IBD分析数据集和遗传聚类数据的格式与内容说明
- 数据类文件
- 文件名称:IBD_FinalDatasets_Dryad.xlsx、cacws_genalex_pops.xlsx、cacws_genalex_clusters.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含遗传数据(sheet: data)和地理坐标数据(sheet: geo),采用GENALEX格式,记录微卫星基因型、种群聚类结果及样本地理位置信息
- 压缩类文件
- 文件名称:Dispersal_Habitat_Model.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:栖息地模型相关数据压缩包,用于分析栖息地距离与遗传距离的关联
数据来源
Dryad数字资源库(对应论文Habitat fragmentation in coastal southern California disrupts genetic connectivity in the Cactus Wren)
适用场景
- 种群遗传学研究:分析仙人掌鹪鹩种群遗传结构、聚类模式及遗传多样性变化
- 栖息地破碎化生态效应评估:探究城市化导致的栖息地破碎化对物种遗传连通性的影响机制
- 保护生物学应用:为濒危或受威胁物种的栖息地保护与连通性修复提供数据支持
- 景观遗传学分析:验证栖息地模型与遗传距离的关联,优化物种生境管理策略
- 生态模型构建:基于栖息地模型数据,预测物种扩散路径及种群动态变化