数据集概述
本数据集包含棘皮动物门(Echinodermata)系统发育研究的相关数据,重点分析了神秘深海生物Xyloplax的分类地位,通过分子序列和发育数据证明其为海星纲翼海星科(Pterasteridae)的幼态持续物种,而非独立纲。数据支持对棘皮动物高级分类关系的研究,共含70个文件。
文件详解
- 分子序列文件
- 文件名称:如18S.reg2.2.may4cos.compress.fas、coi.may4.compress.fas等
- 文件格式:FAS
- 字段映射介绍:包含18S rDNA、28S rDNA、COI、H3等核基因与线粒体基因的序列数据,用于系统发育分析
- 系统发育树文件
- 文件名称:如19834.first.tre.zip、taxa86new.gapcost1tv2ts1.morph36charfinal.h3pre.first19834.best.tre.zip等
- 文件格式:ZIP(压缩树文件)
- 字段映射介绍:存储系统发育分析得到的进化树结构,记录物种间的亲缘关系
- 文本说明文件
- 文件名称:如README_for_18S.region1.may4.compress.fas.txt、README_for_primers.txt等
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含数据文件说明、引物信息、分类单元列表、序列登录号等辅助信息
- 其他数据文件
- 文件名称:如pheno8636charafinal.tnt(形态数据)、accessionsfinal.xls(登录号表格)等
- 文件格式:TNT、XLS等
- 字段映射介绍:存储形态特征矩阵、序列登录号等补充数据
数据来源
Dryad数据仓库(http://dx.doi.org/10.5061/dryad.1926)
适用场景
- 棘皮动物系统发育研究: 分析棘皮动物门五个现存纲的分类关系及进化历史
- Xyloplax分类地位验证: 验证Xyloplax作为翼海星科幼态持续物种的分类学结论
- 分子系统学方法应用: 探索不同分析参数和方法对高级分类单元系统发育结果的影响
- 深海生物进化研究: 研究深海环境中棘皮动物(如Xyloplax)的形态特化与进化适应机制