数据集概述
本数据集通过CRISPR技术构建KRAS敲除的胰腺癌细胞系CFPAC1(原细胞系携带KRASG12V突变),对比分析KRAS完整与敲除细胞的基因表达差异,识别出参与蛋白质合成、细胞分化和代谢过程的基因集,同时发现MAPK/ERK靶基因表达未受影响。数据集包含2个文件。
文件详解
- README.md
- 文件格式:MD
- 字段映射介绍:包含数据集标题、DOI链接、细胞系构建方法(CRISPR/Cas9敲除流程、sgRNA使用、敲除效率验证、技术重复设置、基因组DNA提取及测序PCR扩增方法等信息)
- CFPAC1.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:存储KRAS完整与敲除胰腺癌细胞系CFPAC1的基因表达分析数据,包含基因表达量对比及差异基因相关信息
数据来源
Dryad数据库(DOI: 10.5061/dryad.z8w9ghxks)
适用场景
- 胰腺癌分子机制研究: 分析KRAS基因敲除对胰腺癌细胞基因表达的影响,探究KRAS在胰腺癌发生发展中的作用
- 癌症代谢与分化研究: 基于差异基因集,研究蛋白质合成、细胞分化及代谢过程相关基因在胰腺癌中的功能
- 肿瘤治疗靶点筛选: 探索KRAS敲除后未受影响的MAPK/ERK靶基因,为胰腺癌靶向治疗提供潜在靶点参考
- 基因编辑技术应用评估: 验证CRISPR技术在胰腺癌细胞系中进行基因敲除的效率及实验设计合理性