数据集概述
本数据集为美洲獾(Taxidea taxus)精细尺度景观遗传学研究的基础数据,包含233只美洲獾的12个微卫星位点基因分型数据、分析代码及威斯康星州景观变量数据。研究通过冗余分析(RDA)和空间滞后回归量化景观因子对基因流的影响,并通过模拟评估空间偏倚采样误差,为理解该物种的遗传连通性提供数据支持。
文件详解
- 文件名称:WIGenotypes.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:威斯康星州美洲獾基因分型数据,包含Mel111、Mel14、Mel1、Tt1、Tt2、Ma1、Tt3、Tt4、Mvis072、Mel101等12个微卫星位点的基因数据。
- 文件名称:WI_DryadCode.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:研究分析所用代码文件,用于复现景观遗传学统计分析过程。
- 文件名称:WisconsinVariables.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:威斯康星州景观变量数据,包含可能影响美洲獾基因流的地理、生态等景观因子信息。
数据来源
论文“Fine-scale landscape genetics of the American badger (Taxidea taxus): disentangling landscape effects and sampling artifacts in a poorly understood species”
适用场景
- 景观遗传学分析:用于研究美洲獾种群的遗传连通性与景观特征(如河流、土地覆盖)的关系。
- 微卫星基因分型研究:分析233只美洲獾12个微卫星位点的遗传多样性和种群结构。
- 统计方法验证:通过冗余分析(RDA)和空间滞后回归方法,验证景观因子对基因流的影响。
- 采样误差评估:利用模拟数据评估空间偏倚采样对遗传分析结果的影响,优化采样设计。