数据集概述
本数据集围绕主要组织相容性复合体（MHC）基因的NGS分型优化展开，包含三刺鱼MHC-I和MHC-II基因的分型数据及表达分析结果，用于评估不同分型流程的准确性及模板特异性优化的重要性，支持等位基因特异性表达研究。
文件详解
- README.md
- 文件格式：MD
- 字段映射介绍：包含数据集描述、文件结构说明及数据引用信息，链接至DOI：10.5061/dryad.qfttdz0qb
- Data_MHC-II.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含三刺鱼MHC-IIβ基因的gDNA、cDNA及质粒样本分型数据，涉及DOC、AmpliSAS、ACACIA三种流程的评估结果及等位基因表达水平统计
- Data_MHC-I.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含10个三刺鱼家系的MHC-I基因分型数据，分三个工作表：家系概况、分型结果及等位基因表达分析，支持同胞辅助cDNA分型及单倍型推断
数据来源
DRYAD数据库（DOI：10.5061/dryad.qfttdz0qb）
适用场景
- MHC基因分型流程优化研究：评估DOC、AmpliSAS、ACACIA等NGS分型流程在不同模板（gDNA、cDNA、质粒）下的准确性及参数调整策略
- 等位基因特异性表达分析：通过配对gDNA-cDNA分型数据，研究MHC-II等位基因表达水平与单倍型等位基因数量的相关性
- 分子遗传学研究：利用MHC-I家系数据开展单倍型推断及等位基因多样性分析
- 基因表达偏倚校正：通过模板特异性参数优化，提高cDNA样本分型精度，支持无偏倚的MHC基因表达定量分析
