数据集概述
本数据集来自野外互移植实验,旨在检测Saccharomyces paradoxus菌株对其分离生境(橡树或落叶松凋落物)的适应性。通过数字 droplet PCR(DDPCR)追踪基因型频率变化,测量菌株相对适合度。数据集包含原始DDPCR输出和元数据及处理后结果,共2个文件,用于分析微生物在自然环境中的适合度差异及适应机制。
文件详解
- 说明文档
- 文件名称:README_for_ddPCR data for Saccharomyces paradoxus.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含数据集说明,描述两个CSV文件(原始DDPCR输出、元数据及处理后结果)的内容,涉及野外实验中Saccharomyces paradoxus菌株相对频率的DDPCR检测结果。
- 压缩文件
- 文件名称:ddPCR data for Saccharomyces paradoxus.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含两个CSV文件:
- s_paradoxus_local_adaptation_raw_DDPCR_output.csv:逗号分隔表,含QuantaSof生成的原始DDPCR数据;
- s_paradoxus_local_adaptation_metadata_and_processed_DDPCR_output.csv:含元数据及处理后的DDPCR结果,记录菌株适合度相关的实验数据。
数据来源
Dryad
适用场景
- 微生物适应性研究:分析Saccharomyces paradoxus菌株对不同生境(橡树/落叶松凋落物)的适应差异。
- 野外适合度检测方法验证:评估DDPCR技术在自然环境中测量微生物相对适合度的准确性和实用性。
- 基因型频率动态分析:通过追踪菌株频率变化,研究微生物种群在野外的动态演变。
- 进化生态学研究:探讨分散限制、遗传漂变及选择压力对微生物种群结构的影响。