数据集概述
本数据集围绕达尔文归化难题展开,通过群落系统发育和功能性状分析,探究圣胡安群岛80个岛屿中入侵物种与本地群落的亲缘关系和功能差异。数据包含系统发育树、功能性状、群落组成等多类型文件,可用于验证入侵物种成功机制,支持环境过滤与竞争互作的生态学研究。
文件详解
- 系统发育相关文件
- 文件名称:DRYAD4_SJtreePL.bootstrap.tre
- 文件格式:.tre
- 字段映射介绍:包含圣胡安群岛植物群落的系统发育树,记录物种间的进化关系及bootstrap支持度
- 文件名称:Alignments.zip
- 文件格式:.zip(压缩包)
- 字段映射介绍:包含用于构建系统发育树的序列比对数据
- 文件名称:Treefiles.zip
- 文件格式:.zip(压缩包)
- 字段映射介绍:包含系统发育分析相关的树文件
- 群落组成数据
- 文件名称:DRYAD1_ComMatrix.csv
- 文件格式:.csv
- 字段映射介绍:记录岛屿植物群落的物种组成矩阵,包含物种在各岛屿的分布信息
- 功能性状数据
- 文件名称:DRYAD2_SJtraits.csv
- 文件格式:.csv
- 字段映射介绍:包含物种状态(本地/入侵)、种子质量、最大高度、比叶面积(SLA)、叶大小、叶氮含量等功能性状数据
- 群落摘要数据
- 文件名称:DRYAD3_SJcomSummary.csv
- 文件格式:.csv
- 字段映射介绍:包含岛屿面积、物种总数、本地/入侵物种数及占比、系统发育末端数等群落水平统计信息
数据来源
DRYAD数据库(对应论文:Deconstructing Darwin's naturalization conundrum in the San Juan Islands using community phylogenetics and functional traits)
适用场景
- 入侵生态学研究:分析入侵物种与本地群落的系统发育亲缘关系及功能性状差异,验证达尔文归化难题的双机制假说
- 群落系统发育分析:利用系统发育树和性状数据,探究物种进化历史对群落构建的影响
- 功能性状生态学:研究种子质量、最大高度等功能性状与入侵成功的关联
- 岛屿生物地理学研究:结合岛屿面积、物种丰富度等数据,分析岛屿特征对入侵物种分布的影响
- 环境过滤与竞争互作机制验证:通过系统发育聚类和功能分化模式,区分环境过滤与竞争排斥在入侵过程中的作用