数据集概述
本数据集基于ddRAD测序技术，分析了欧洲12个种群276只银行田鼠的基因组数据（21,892个SNPs）与地理气候变异的关联，识别出213个适应候选位点（74个位于基因内），涉及脂质代谢和免疫系统相关基因，揭示气候对其适应性遗传变异的影响，包含9个相关文件。
文件详解
- 说明文件
- 文件名称：README.md
- 文件格式：MD
- 字段映射介绍：记录数据集生成信息、数据来源（DOI链接）、研究方法概述及文件组成说明
- 样本元数据文件
- 文件名称：SamplesMetaData.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含银行田鼠样本的基础元数据信息（推测涵盖种群、个体标识等关联信息）
- 气候数据文件
- 文件名称：BioClim_Pops.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含Population（种群）、Location（位置）、Latitude（纬度）、Longitude（经度）、Ave_pairwise_dist（平均成对距离）及wc2.0_b_01至wc2.0_b_13等生物气候变量字段
- 基因组数据文件
- 文件名称：Pops12.ind12.vcf
- 文件格式：VCF
- 字段映射介绍：包含12个种群银行田鼠的21,892个SNPs基因组变异数据
- 分析方法结果压缩包
- 文件名称：LFMM.zip、Bayenv2.zip、Polygenic_scores.zip、RDA.zip、MantelTests.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：分别存储基于LFMM、Bayenv2方法的基因型-环境关联分析结果、多基因分数计算结果、冗余分析结果及 Mantel检验结果相关文件
数据来源
Dryad数据库（DOI: 10.5061/dryad.1c59zw42p）
适用场景
- 动物气候适应性基因组研究：分析银行田鼠种群中气候介导的适应性遗传分化及候选基因功能
- 基因型-环境关联分析方法验证：对比不同GEA方法（LFMM、Bayenv2）在自然种群中的应用效果
- 生物气候变量与遗传变异关联研究：探究年平均温度等气候因子对基因组适应性变异的塑造作用
- 种群遗传学分析：结合冗余分析和Mantel检验结果，研究种群历史与气候对遗传变异的联合影响
- 生态基因组学教学与实践：作为景观基因组学研究的案例数据，用于相关方法的教学演示与实操训练
