数据集概述
本数据集来自Dryad平台,围绕北美太平洋沿岸海葵Anthopleura elegantissima的群体遗传结构展开研究,探讨选择压力与基因流对其局部适应的影响。包含约一千一百个基因位点的分析数据,涉及隔离距离模式、历史种群扩张及选择位点检测等内容,共七个文件,用于揭示该物种种群遗传格局的主导驱动因素。
文件详解
- 元数据文件
- 文件名称:DRYAD_Metadata_Aelegantissima.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含数据集相关的元数据信息,具体字段未提供预览
- 基因分型数据文件
- 文件名称:Aelegantissima.bed
- 文件格式:BED
- 字段映射介绍:群体遗传学研究中常用的基因分型数据格式文件
- 家系信息文件
- 文件名称:Aelegantissima.fam
- 文件格式:FAM
- 字段映射介绍:包含样本家系、性别等信息的文本文件
- 标记定位文件
- 文件名称:Aelegantissima.map
- 文件格式:MAP
- 字段映射介绍:记录遗传标记染色体定位信息的文本文件
- 基因型数据文件
- 文件名称:Aelegantissima.ped
- 文件格式:PED
- 字段映射介绍:以PED格式存储的样本基因型数据文本文件
- 性别信息文件
- 文件名称:Aelegantissima.nosex
- 文件格式:NOSEX
- 字段映射介绍:包含样本性别信息的文本文件
- 标记信息文件
- 文件名称:Aelegantissima.bim
- 文件格式:BIM
- 字段映射介绍:记录遗传标记详细信息的文本文件
数据来源
Dryad平台(论文关联数据)
适用场景
- 群体遗传学研究:分析Anthopleura elegantissima种群的遗传结构与隔离距离模式
- 进化历史重建:基于基因流数据探讨物种历史种群扩张过程与地理分布动态
- 局部适应机制研究:检测选择位点,评估选择压力与基因流对局部适应的相对影响
- 海洋物种适应性进化分析:为海洋环境下物种适应性进化的驱动因素研究提供数据支持
- 共生关系进化研究:结合内共生体Breviolum muscatinei数据,分析跨地理范围的共生互作进化后果