数据集概述
本数据集围绕蝴蝶宿主细菌群落展开,分析12种蝴蝶不同发育阶段的细菌群落特征,探究宿主饮食转变对细菌群落的影响。数据包含原始与处理后的OTU表、样本信息、核心OTU数据、多样性分析及统计检验代码等,揭示蝴蝶物种和科属身份对细菌群落的强影响,以及幼虫细菌群落与饮食的关联性。
文件详解
- 数据文件(.xlsx格式,共8个)
Sample_Info.xlsx:样本信息表,包含样本编号及对应元数据
Raw_OTUreads_per_sample_No_Cutoff_applied.xlsx:无过滤的原始OTU读数表
OTU_Table_5%_abundnace_Cut-off.xlsx:5%丰度过滤的OTU表
OTU_Table_0.005%_abundnace_Cut-off.xlsx:0.005%丰度过滤的OTU表
OTU_Table_minimum_20_reads_Cut-Off.xlsx:最低20条读数过滤的OTU表
OTU_Table_Top5_OTUs_for_each_species.xlsx:各物种前5个OTU的汇总表
Core_OTUs.xlsx:核心OTU数据
- 代码文件(.R格式,共3个)
CAPdiscrim.R:CAP判别分析代码
Diversity_measurements.R:多样性计算代码
PERMANOVA_Adonis_Vegan.R:基于Vegan包的PERMANOVA统计检验代码
- 文档文件(.txt格式,共1个)
Read_Me.txt:数据说明文档,包含文件读取指引及样本编号参考说明
数据来源
Dryad数据库(数据标题:Data from: Dietary and developmental shifts in butterfly-associated bacterial communities)
适用场景
- 微生物生态学研究:分析蝴蝶宿主细菌群落的组成特征及驱动因素
- 宿主-微生物互作分析:探究蝴蝶饮食转变与发育阶段对细菌群落的影响机制
- 生物信息学数据分析:利用OTU表及R代码开展微生物多样性统计与可视化
- 进化生物学研究:验证蝴蝶物种系统发育关系对细菌群落结构的影响
- 昆虫生理学研究:解析幼虫细菌群落与宿主饮食的关联性及获取机制