Dryad_MER14_0028_Ficedula鹟属连锁不平衡与基因流分析数据

数据集概述

本数据集基于定制50K SNP芯片,包含Ficedula属鹟类(如白领姬鹟与斑姬鹟)的基因分型数据,用于分析连锁不平衡(LD)模式、基因组分化岛特征及种间杂交情况。数据支持鸟类进化基因组学研究,揭示近缘物种的生殖隔离机制与快速进化过程。

文件详解

  • 文档文件
  • 文件名称:README_for_Dryad_MER14-0028.zip.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:说明数据集内容,包含PLINK格式文件的字段定义(如家系ID、个体ID、性别、基因型位点等)及染色体编码规则(因PLINK不适用鸟类基因组,染色体统一标注为NA)。
  • 压缩文件
  • 文件名称:Dryad_MER14-0028.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 字段映射介绍:包含PLINK格式的基因数据文件,包括.map(SNP标识符、位置信息)和.ped(家系、个体、性别及45138个位点的基因型数据)。

数据来源

Dryad数字资源库(关联论文:Estimation of linkage disequilibrium and interspecific gene flow in Ficedula flycatchers by a newly developed 50k SNP array)

适用场景

  • 连锁不平衡分析: 研究Ficedula鹟属基因组中LD衰减模式,评估基因组分化岛的LD水平差异。
  • 种间基因流研究: 利用基因型数据识别F1代杂交个体,分析近缘物种的生殖隔离强度。
  • 鸟类进化基因组学: 探讨百万年尺度内生殖不亲和性的快速进化机制。
  • 分子标记开发: 基于50K SNP芯片数据,优化鸟类基因组研究的分子标记选择策略。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 12.14 MiB
最后更新 2026年1月15日
创建于 2026年1月15日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。