数据集概述
本数据集是澳大利亚特有有袋类动物岩袋鼠属(Petrogale)染色体物种形成研究的相关数据存档,包含与论文配套的数据和代码。内容涉及外显子捕获的系统发育结果,以及用于整合比较基因组序列数据与分子细胞遗传学证据的相关资料,旨在揭示染色体结构重组如何推动物种分化,总计包含2个文件。
文件详解
- README文档
- 文件名称:
README_for_Dryad archive Petrogale.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含数据集说明,记录数据和代码对应的论文信息、样本信息文件(library_sample_Petrogale.csv)的内容说明,以及NCBI序列读取档案库(SRA)的生物项目编号等信息。
- 压缩存档文件
- 文件名称:
Dryad archive Petrogale.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩包内包含与论文相关的原始数据和代码,具体内容需解压后查看。
数据来源
Dryad存档(关联论文:Potter S等《Chromosomal speciation in the genomics era: disentangling phylogenetic evolution of rock-wallabies》)
适用场景
- 染色体物种形成机制研究:分析岩袋鼠属物种分化与染色体结构重组的关联,探索基因组结构变化对物种形成的推动作用。
- 非模式生物基因组进化分析:以岩袋鼠属为案例,研究非模式生物中染色体重排与基因流、系统发育关系的相互影响。
- 比较基因组学研究:整合基因组序列数据与分子细胞遗传学证据,开展跨物种的比较基因组分析。
- 物种分化过程解析:通过外显子捕获数据的系统发育结果,解析近期物种辐射中基因树异质性的成因,包括近期分化和基因流的影响。