数据集概述
本数据集为论文《墨西哥起源中心马铃薯晚疫病菌的高多样性与种群结构》的补充材料，包含13个文件，主要为分析输入输出文件及说明文档。数据覆盖墨西哥中部米却肯、特拉斯卡拉和托卢卡地区的疫霉菌种群研究，支持种群结构、遗传多样性、地理关联性等分析，为理解该病菌全球传播及再出现机制提供基础。
文件详解
- 说明文档：
- 文件名称：README.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含数据集说明，说明内容为论文的Dryad补充文档，含R命令（若有）、各分析的输入输出文件，文件夹名称对应分析类型，Rmarkdown生成的html文件含详细介绍。
- 分析数据压缩包（共12个.zip文件）：
- 文件名称示例：Pinf9_full_MSN_DAPC_3alleles_info_checked.zip、Pinf3Mexpops_full_and_LC_farthest_AMOVA_checked.zip等
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：各压缩包对应不同分析内容，包括DAPC分析、AMOVA分析、LD与HWE分析、Migrate分析、ADZE分析、STRUCTURE分析、群体摘要统计等相关的输入输出数据。
数据来源
论文“High levels of diversity and population structure in the potato late blight pathogen at the Mexico center of origin”的Dryad补充材料
适用场景
- 植物病理学研究：分析墨西哥马铃薯晚疫病菌的遗传多样性及种群结构，探究其起源中心特性。
- 农业病害防控：基于病菌种群地理关联性，为马铃薯晚疫病的区域及全球防控策略制定提供数据支持。
- 种群遗传学分析：利用AMOVA、STRUCTURE等分析数据，研究病菌种群分化与基因流动机制。
- 病害再出现机制研究：结合墨西哥种群结构与美国克隆谱系的关联性，解析晚疫病菌重复再出现的原因。
- 生物信息学方法验证：使用数据集的分析输入输出文件，验证种群遗传分析工具（如DAPC、Migrate）的应用效果。
