数据集概述
本数据集为大肠杆菌UV抗性进化实验的基因组特征数据,通过实验进化结合全基因组全种群测序,研究不同生长阶段(滞后期、指数期)UV暴露下的进化结果差异。数据包含两组处理的突变基因功能分析结果,揭示不同生理状态下适应的基因组特征差异。
文件详解
- 文件名称:Selveshwari_et_al_JEB_2021-DryadData.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含大肠杆菌在滞后期、指数期UV暴露处理下的基因组突变数据,涉及DNA修复、细胞膜结构、RNA聚合酶等功能基因的突变信息,以及不同处理组特有的突变功能群(转录翻译调控、细胞转运;信号转导、细胞黏附)的统计分析内容。
数据来源
DryadData(关联论文:Genomic signatures of UV resistance evolution in Escherichia coli depend on the growth phase during exposure)
适用场景
- 微生物进化适应性研究:分析不同生理状态下大肠杆菌对UV压力的进化响应及基因组特征差异。
- 分子遗传学机制分析:探究DNA修复、细胞膜结构等基因在UV抗性进化中的作用。
- 功能基因组学研究:比较不同生长阶段适应过程中突变基因的功能类群差异。
- 进化表型关联分析:验证基因组突变与UV抗性表型的对应关系,探索无表型差异的基因组适应机制。