DSM_Based_神经元形态学表示与特征提取研究数据

数据集概述

本数据集为研究“DSM: Deep Sequential Model for Complete Neuronal Morphology Representation and Feature Extraction”的开源资源,包含神经元重建原始数据、补充资料、Python工具包及开发者资源,支持神经元形态学的序列转换与模型实现,可用于神经元形态学的表示、特征提取及相关模型开发。

文件详解

  • raw_dataset.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 内容介绍:包含SEU-Allen数据集的1282个神经元重建数据、Janelia数据集的1002个神经元重建数据、ION数据集的1100个神经元重建数据
  • Supplementary.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 内容介绍:补充信息,包含表格和图表
  • DSM-tools.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 内容介绍:Python工具包,包含NeuronSequenceDataset类(将SWC文件转换为序列数据框)、DSMDataConverter类(转换序列数据框用于分类和聚类)、DSMHierarchicalAttentionNetwork类(分类模型,默认提供预训练DSM-HAN模型)、DSMAutoencoder类(聚类模型,默认提供预训练DSM-AE模型)
  • neuron2seq_for_developer.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 内容介绍:模型进一步开发的资源库,包含源代码和所有数据文件

数据来源

研究“DSM: Deep Sequential Model for Complete Neuronal Morphology Representation and Feature Extraction”的开源仓库

适用场景

  • 神经元形态学研究: 用于分析不同数据集(SEU-Allen、Janelia、ION)中神经元的形态特征
  • 深度学习模型开发: 基于DSM-tools实现神经元形态学的序列转换与模型训练,支持分类和聚类任务
  • 神经元形态学特征提取: 利用预训练的DSM-HAN和DSM-AE模型提取神经元形态学特征
  • 神经科学工具开发: 基于neuron2seq_for_developer资源库进行神经元形态学相关工具的二次开发
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 336.96 MiB
最后更新 2026年1月30日
创建于 2026年1月30日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。