数据集概述
该数据集包含用于独立可调低噪声基因表达质粒研究的DNA序列、原始实验数据及分析代码。涵盖质粒的GenBank格式注释序列、流式细胞术与显微镜原始数据，以及可生成论文图表的Python脚本和Fiji宏，支持相关实验结果的复现与扩展分析。
文件详解
该数据集为压缩包形式，内部包含DNA序列、实验数据及分析代码三大类文件，具体说明如下：
- DNA序列文件（\dna sequences目录）：
- 包含pDG101.gb、pJS101.gb（AddGene #118280）、pJS102.gb（AddGene #118281）、pZH501.gb、pZH509.gb（AddGene #102664）、pZH713.gb、ZHX99.gb等文件，均为GenBank格式的注释DNA序列，部分为质粒序列，ZHX99.gb为大肠杆菌染色体插入突变体序列。
- 实验数据文件（\data目录）：
- DG FCS Data：BioRad S3流式细胞仪原始数据，按实验日和条件分类，文件名含质粒、诱导剂浓度及单位信息，格式为.fcs。
- pJS101 pDG101 independence子目录：
- quick scope intensity.ijm：用于提取平均荧光强度的Fiji宏文件。
- Microscope Data：经上述Fiji宏分析的显微镜数据，目录名含ATc和IPTG浓度信息。
- intensity analysis子目录：含各条件的CSV数据文件（如X_nM_ATc_Y_uM_IPTG.csv）、背景扣除用backgrounds.csv。
- images for Figure 4：生成论文图4A和4B的原始图像栈。
- 分析代码文件（\code目录）：
- fcsAnalysis_final_181228.py：从FCS数据生成图1和图2的分步脚本。
- fcsCalcDirectory181228.py：含FCS分析与图表生成函数的脚本。
- fcsImages：FCS分析脚本输出的PDF图表。
- FlowCal-master：分析所用FlowCal库的MIT许可证分发版。
- scopeAnalysisWorkflow190430.py：从Fiji导出的CSV格式显微镜数据生成图4C和4D的分步脚本。
- scopeCalcDirectory190430.py：含显微镜数据分析与图表生成函数的脚本。
适用场景
- 分子生物学研究：用于质粒序列的获取、验证及基因表达调控机制的实验复现。
- 生物信息学分析：流式细胞术与显微镜数据的处理方法参考，支持基因表达噪声相关研究。
- 实验方法学参考：流式细胞仪与荧光显微镜数据的标准化分析流程构建。
- 学术论文复现：依据提供的脚本和数据，复现原论文中的关键图表（图1、2、4）。
