多背景遗传建模TWAS和eAssociation汇总统计数据集

数据集概述

本数据集包含CONTENT(多背景方法)、UTMOST方法在22种表型上的汇总统计,以及基于GTEx和CLUES训练的eAssociation数据,涵盖基因名、模型、交叉验证R²、预测p值、TWAS结果等核心字段,支持遗传关联分析。

文件详解

  • 压缩文件:
  • zenodo_twas.zip: ZIP格式压缩包,包含CONTENT、UTMOST方法在22种表型上的TWAS汇总统计,字段包括基因名、模型、交叉验证R²、预测p值、TWAS p值、TWAS Z值、hFDR(分层FDR显著性标识)
  • zenodo_eassociations.zip: ZIP格式压缩包,包含基于GTEx和CLUES训练的eAssociation数据,字段包括基因、背景、p值、调整后R²;CONTENT模型字段含rsq_observed_full(观测表达对交叉验证全模型预测的调整后R²)等回归相关指标

适用场景

  • 遗传流行病学研究: 分析多背景遗传模型与表型的关联
  • 转录组关联分析(TWAS): 验证不同方法(CONTENT、UTMOST)的TWAS结果差异
  • 基因表达预测模型评估: 基于交叉验证R²等指标比较模型性能
  • 统计方法学研究: 探索分层FDR在遗传关联分析中的应用价值
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 882.87 MiB
最后更新 2025年12月19日
创建于 2025年12月19日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。