数据集概述
本数据集是论文“Estimating parent-specific QTL effects through cumulating linked identity-by-state SNP effects in multiparental populations”的补充数据,包含大麦嵌套关联作图(NAM)群体HEB-25和多亲高级世代互交(MAGIC)群体的相关遗传数据,用于比较IBS和IBD基因型建模对QTL效应估算的影响,支持植物遗传学家分析农艺性状的遗传结构。数据集共包含5个Excel文件。
文件详解
- 文件名称:Additional data File 1 - IBS and IBD matrices_revised.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含大麦多亲群体的IBS(状态一致)和IBD(血统一致)基因型矩阵修订版,用于QTL效应估算的基因型建模基础数据
- 文件名称:Additional data File 2 - All phenotype data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:涵盖大麦多亲群体研究的四个农艺性状表型数据,是QTL关联分析的表型输入数据
- 文件名称:Additional data File 3 - All significant markers and effect estimates.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录所有显著分子标记信息及其效应估算结果,用于比较IBS和IBD模型的QTL检测效率
- 文件名称:Additional data File 4 - Markers in complete LD.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含完全连锁不平衡(LD)的分子标记列表,支持QTL区域的连锁分析
- 文件名称:Additional data File 5 - iSelect marker names.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录iSelect平台的分子标记名称列表,对应基因型数据中的标记标识
数据来源
论文“Estimating parent-specific QTL effects through cumulating linked identity-by-state SNP effects in multiparental populations”
适用场景
- 植物遗传QTL效应分析:用于比较IBS和IBD基因型建模对大麦多亲群体QTL效应估算的准确性和预测能力
- 农艺性状遗传结构研究:通过显著标记及效应估算数据,分析大麦重要农艺性状的遗传基础
- 连锁不平衡分析:利用完全LD标记数据,研究大麦基因组中标记间的连锁关系
- 多亲群体遗传建模优化:为植物遗传学中多亲群体的基因型数据处理和QTL定位方法提供参考