数据集概述
本数据集是关于多药耐药阴沟肠杆菌在英国及爱尔兰传播研究的补充数据，包含基因、微生物学特征、单核苷酸多态性等核心数据文件及分析代码，为耐药菌传播机制研究提供支持。
文件详解
- 数据文件：
- Metadata.csv：CSV格式，包含SangerID、最低抑菌浓度（MIC）数据（如amc、amx等抗生素）、多位点序列分型（MLST）等字段
- gene_presence_absence.csv：CSV格式，包含基因名称、注释、分离株数量、泛基因组分析结果及各菌株基因存在情况等字段
- SNP.out：其他格式，包含已识别的单核苷酸多态性（SNP）列表，用于回归模型输入
- 代码文件：
- RCode.R：R格式，用于回归分析的R代码文件
- 压缩文件：
- pan_genome_sequences.zip：ZIP格式，包含泛基因组中基因序列的压缩文件夹
- 说明文件：
- README.txt：TXT格式，包含文件及文件夹列表说明
适用场景
- 微生物学研究：分析多药耐药阴沟肠杆菌的耐药表型与基因型关联
- 基因组学分析：探究泛基因组特征及单核苷酸多态性对耐药性的影响
- 流行病学研究：辅助研究多药耐药菌在区域内的传播机制与流行规律
- 生物信息学应用：验证耐药相关基因分析模型及算法的有效性
