数据集概述
本数据集围绕东非坦噶尼喀湖特有4个慈鲷部落的演化研究,通过分支形态演化模型分析物种形成、灭绝及形态演化速率差异。包含200组参数组合与4种模型条件的模拟结果,用于推断演化速率差异,强调考虑分支年龄和随机性对形态多样性解释的重要性。数据集含10个文件,支持相关统计分析与模型验证。
文件详解
- 说明文件(Document files)
- 文件名称:README_for_Time_MinMax_Model.txt、README_for_Speciation_NoMax_Model.txt、README_for_Matrixcalcs.txt、README_for_Speciation_MinMax_Model.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:各模型对应的说明文档,解释模型功能、使用方法及参数设定
- 模型文件(Model files)
- 文件名称:Time_MinMax_Model.txt、Speciation_NoMax_Model.txt、Speciation_MinMax_Model.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含演化模型的核心代码与参数配置,用于R环境中计算演化速率差异
- 计算文件(Calculation files)
- 文件名称:Matrixcalcs.txt、Varcount.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:概率矩阵计算代码(Matrixcalcs.txt)及变量计数数据(Varcount.txt),支持分支间演化速率比较
- 数据文件(Data files)
- 文件名称:FishBase_data_compilation.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:FishBase数据库编译的慈鲷数据,包含形态特征、物种数量等演化分析基础数据
数据来源
论文“Testing for differences in rates of speciation, extinction, and morphological evolution in four tribes of cichlids endemic to Lake Tanganyika, East Africa”
适用场景
- 生物演化速率研究: 分析坦噶尼喀湖慈鲷部落间物种形成、灭绝及形态演化速率差异
- 形态多样性解释: 探究分支年龄与随机性对慈鲷形态差异的影响机制
- 演化模型验证: 测试分支形态演化模型在不同参数条件下的稳健性与适用性
- 生态适应性分析: 关联慈鲷食性多样性(如Cyprichromini部落低食性多样性)与演化速率的关系
- 生物统计方法应用: 利用R代码实现概率矩阵计算,支持跨分支演化特征比较研究