数据集概述
本数据集包含滨螺Echinolittorina hawaiiensis壳雕多态性相关的AFLP基因组扫描数据,来自四个重复位点不同生境的光滑型和雕刻型螺类样本。数据用于检测选择信号,探讨广布海洋生物在分歧选择压力下的基因组分化,共含两个文件。
文件详解
- 文件名称:README_for_Tice&Carlon_JEB_data.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:提供数据集说明文档,解释Excel文件中工作表的内容和结构。
- 文件名称:Tice&Carlon_JEB_data.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含两个工作表
- Locus Information Worksheet:汇总AFLP位点信息,字段包括Primer(引物组合,A-F)、Locus Number(位点编号)、Size(位点长度,碱基对)
- Genotypes by Locus # Worksheet:记录所有螺类样本的基因型数据,涵盖1073个位点
数据来源
论文“Can AFLP genome scans detect small islands of differentiation? The case of shell sculpture variation in the periwinkle Echinolittorina hawaiiensis”
适用场景
- 基因组选择信号检测:分析滨螺壳雕多态性相关的候选基因区域,探讨选择压力对表型变异的影响
- 海洋生物适应性进化研究:研究广布海洋生物在不同生境中的基因组分化机制
- 分子生态学方法验证:比较不同离群位点检测方法(如Dfdist、BayeScan)在海洋生物中的应用效果
- 滨螺表型-基因型关联分析:结合壳雕表型数据,探究基因型与表型变异的相关性