数据集概述
本数据集包含11种软松(松属软松亚属)的167个直系同源核基因片段的DNA序列比对数据,用于研究其适应性进化。研究通过分析非同义突变的适应性比例(α)和有害 fitness 效应分布(DFE),发现多数新非同义突变具有强有害性,长期适应性进化证据不足,符合近中性理论预期。数据以压缩包形式提供,含1个文件。
文件详解
- 文件名称:Eckert_et_al_pairwise_alignments.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 字段映射介绍:压缩包内包含11种软松的167个直系同源核基因片段的两两比对序列数据,具体字段需解压后查看,推测包含基因ID、物种信息、核苷酸序列比对结果等核心分子数据。
数据来源
论文“Multilocus analyses reveal little evidence for lineage wide adaptive evolution within major clades of soft pines (Pinus subgenus Strobus)”
适用场景
- 植物分子进化研究:分析软松亚属物种的适应性进化模式,验证近中性理论的适用性。
- 有害突变效应分析:探究不同软松物种的有害 fitness 效应分布(DFE)特征。
- 基因选择压力评估:通过非同义突变比例(α)评估基因座的长期选择压力。
- 基因组进化推断:结合核基因片段数据,推断软松亚属基因组水平的进化趋势与偏差。