数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C. elegans)ED3049野生株(采自南非Ceres)的行为实验数据,属于线虫行为数据库的一部分。记录了成虫在特定培养基和食物条件下的运动行为,包含实验参数、视频追踪数据及特征提取结果,可用于线虫行为模式与神经机制研究。
文件详解
- 核心数据文件(编号:3)
.hdf5文件(2个):包含行为特征数据与原始追踪数据,文件命名遵循764 ED3049 on food L_2011_03_09__17_15_58___7___13[后缀].hdf5格式
.wcon.zip文件(1个):行为数据压缩文件,命名同核心数据文件前缀
- 实验参数:记录线虫品系、性别、发育阶段、培养基类型、食物种类、实验时长(899.033秒)、帧率(30.03帧/秒)、像素分辨率(4.2072微米/像素)等关键信息
- 分析工具:使用tierpsy软件(版本cbfc23eb)进行行为追踪,提取26811个分段骨架特征
数据来源
C. elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫行为模式研究:分析野生株ED3049的运动轨迹、速度等行为特征,探究环境因素对行为的影响
- 神经生物学机制研究:结合行为数据与基因背景,研究线虫神经回路调控行为的分子机制
- 实验方法验证:基于标准实验方案(E. Yemini et al.方法),验证线虫行为实验的可重复性
- 行为分析工具评估:测试tierpsy软件在野生株线虫行为特征提取中的准确性与适用性