数据集概述
本数据集为珊瑚礁鱼类Elacatinus lori的空间遗传结构研究数据，包含核微卫星、线粒体细胞色素b序列等遗传标记数据，以及采样位置、遗传距离矩阵、统计模型输入文件等。通过聚类、网络分析及统计模型探究景观连续性对该鱼类种群遗传结构的影响，为海洋生物遗传连通性研究提供支持。
文件详解
- 遗传数据文件
micros_matrix.txt（TXT）：微卫星遗传距离矩阵FST_mtdna_matrix.txt（TXT）：线粒体DNA的FST矩阵HedricksGST_micros_matrix.txt（TXT）：微卫星的Hedrick's GST矩阵distance_matrix.txt（TXT）：地理距离矩阵haplotypes_fasta.fas（FAS）：线粒体单倍型序列文件microsatellite_genotypes.xlsx（XLSX）：微卫星基因型数据mtdna_haplotype frequencies.xlsx（XLSX）：线粒体单倍型频率数据- 统计模型输入文件
input_mixedmodel_logit.csv（CSV）：混合模型与逻辑回归分析输入数据，含位点对ID、遗传分化指数（Phi_ST、F_ST等）、景观断裂变量（Break）及地理距离（Dist）input_nonzeros.csv（CSV）、input_nonzeros_micros.csv（CSV）：非零遗传分化数据输入文件- 辅助文件
Finalized_RCODE.R（R）：数据分析代码sampling_locations.xlsx（XLSX）：采样位置信息
数据来源
论文“Seascape continuity plays an important role in determining patterns of spatial genetic structure in a coral reef fish”
适用场景
- 海洋生物遗传结构分析：利用微卫星、线粒体DNA数据研究珊瑚礁鱼类种群的遗传分化模式
- 景观遗传学研究：探究景观连续性（如珊瑚礁斑块间海洋屏障）对鱼类基因流的影响
- 统计模型应用：通过逻辑回归、线性混合模型分析遗传分化与环境变量的关联
- 珊瑚礁生态保护：为珊瑚礁鱼类种群的进化显著单元划分及保护策略制定提供数据支持
- 海洋生物 dispersal 研究：结合遗传数据推断鱼类的扩散能力与种群连通性机制
