数据集概述
本数据集包含用于构建生物事实服务(biofactoid.org)grounding-search服务的Elasticsearch索引数据,仅涵盖酿酒酵母(S. cerevisiae)基因信息。数据通过elasticdump npm包生成,提供填充Elasticsearch索引所需的必要信息,共包含3个文件。
文件详解
- 文件名称:groundingsearch_mapping.json
- 文件格式:JSON
- 字段映射介绍:包含Elasticsearch索引的映射配置,结构为对象类型,包含键"groundingsearch"
- 文件名称:groundingsearch_analyzer.json
- 文件格式:JSON
- 字段映射介绍:包含Elasticsearch索引的分析器配置
- 文件名称:groundingsearch_data.json
- 文件格式:JSON
- 字段映射介绍:包含S. cerevisiae基因的具体数据内容
数据来源
PathwayCommons grounding-search项目(https://github.com/PathwayCommons/grounding-search)
适用场景
- 生物信息学数据索引构建: 用于搭建针对S. cerevisiae基因数据的Elasticsearch索引服务
- 生物事实服务开发: 支持biofactoid.org平台的grounding-search功能实现
- 基因数据检索系统部署: 提供标准化的基因数据检索索引配置方案
- 生物信息学工具集成: 可作为相关生物信息学分析工具的基因数据检索模块支撑