鳄梨根际与土壤微生物组数据集

数据集概述

本数据集为鳄梨(Persea americana)根际与土壤微生物组的代谢组测序数据,聚焦有机覆盖物、硅酸盐基覆盖物、亚磷酸盐处理及疫霉菌(Phytophthora cinnamomi)感染对土壤微生物组的影响,包含OTU丰度、序列、分类学信息等核心内容。

文件详解

数据集包含2个Excel文件,具体如下: - 文件名称: all OTU- with taxonomy.xlsx(位于h7jxb8frm2-2/目录下) - 文件格式: Excel (.xlsx) - 包含6个数据工作表: 1. OTUs per sample: 每个样本的OTU丰度,前3行含样本身份描述 2. sequences of each OTU: 各OTU的序列信息 3. taxonomic ID of each OTU: 各OTU的分类学ID 4. combined sheet: 整合工作表1-2的所有信息 5. sheet 4 with plastids removed: 移除叶绿体和线粒体的整合数据 6. selected OTU's: 至少贡献40条读数的筛选OTU(分析用数据集) - 文件名称: selected OTUs.xlsx(位于h7jxb8frm2-2/目录下) - 文件格式: Excel (.xlsx) - 内容: 至少贡献40条读数的筛选OTU数据(即上述工作表6的独立文件)

适用场景

  • 农业微生物学研究: 分析不同土壤处理对鳄梨根际微生物组丰度与多样性的影响
  • 植物病理学研究: 探究疫霉菌感染与土壤微生物组变化的关联机制
  • 生物防治应用: 筛选抑制疫霉菌根腐病的微生物组特征及关键OTU
  • 农业可持续性分析: 评估有机/矿物覆盖物对土壤微生态的调控效应
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 16.15 MiB
最后更新 2025年11月26日
创建于 2025年11月26日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。